Структура ГОБУЗ «МООД» представлена в следующих подразделениях:
- Приёмное отделение
- Отделение абдоминальной онкологии
- Отделение опухолей молочной железы
- Отделение торакальной онкологии и опухолей кожи
- Отделение противоопухолевой лекарственной терапии
- Отделение радиотерапии
- Отделение анестезиологии и реанимации для взрослых с палатами интенсивной терапии
- Дневной стационар для проведения противоопухолевой лекарственной терапии
- Поликлиническое отделение
- Отделение рентгендиагностики
- Отделение ультразвуковой диагностики
- Зндоскопическое отделение
- Патологоанатомическое отделение
- Централизованная цитологическая лаборатория